<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:"Ubuntu Mono";
        panose-1:2 11 5 9 3 6 2 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-GB" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I’m trying to use Bolt to compare performance with Intel/gcc openMP runtimes with taskyield. The code in question is a FORTRAN code, however I’m having issues using bolt (including make ftest)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I’m compiling with Intel 17.2.050, and have attached the c.txt, m.txt and mi.txt discussed in your build process.<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">To run the make ftest I removed the enforcing of –lm (because this is unneeded with intel compiler) and:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">bash-4.1$ export TEST_FC=ifort<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">bash-4.1$ export TEST_FFLAGS="-g -O2 -qopenmp -I/~/INSTALL/bolt/include -L/~/INSTALL/bolt/lib -Wl,-rpath=~/INSTALL/bolt/lib"<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono""><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal">when  the tests progress a little, I get this error:<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">Testing for "omp_threadprivate":<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">Generating sources .............. success<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">Compiling soures ................ success<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">Running test with 8 threads ../bin/fortran/test_omp_threadprivate: relocation error: ./bin/fortran/test_omp_threadprivate: symbol kmp_aligned_malloc, version
 VERSION not defined in file libiomp5.so with link time reference<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">.... failed 100% of the tests<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">The code I which I want to use gives me the same error (and also uses threadprivate variables. Is this something that isn’t supported with FORTRAN yet?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Also  do_collapse causes an internal compiler error with Intel 17.2.050<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">Testing for "do_collapse":<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">Generating sources .............. success<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">Compiling soures ............bin/fortran/test_do_collapse.f(46): internal error: Please visit 'http://www.intel.com/software/products/support' for assistance.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">!$omp end do<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">^<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">[ Aborting due to internal error. ]<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:14.0pt;font-family:"Ubuntu Mono"">compilation aborted for bin/fortran/test_do_collapse.f (code 1)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I already ran the ctests and these worked correctly (a few tests failed but not in such a way)<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thanks,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal">Aidan Chalk<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB">High Performance Software Engineer<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB">Hartree Centre<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</body>
</html>